Taller Hands-On: exprorando herramientas de Ensembl
Uso de herramientas de Ensembl (y Ensembl Genomes)
30 DE SETIEMBRE, 13:30 a 17:30 hs
SALÓN DE CÓMPUTO, FACULTAD DE AGRONOMÍA – UNIVERSIDAD DE LA REPÚBLICA
– Carla Filippi –
INSCRIPCIONES AQUÍ
Situación: hiciste un RNAseq y tenés la tabla de DEGs (genes diferencialmente expresados), pero no estás seguro de cómo seguir. ¿Querés descargar las secuencias promotoras de un grupo de genes de interés, sus anotaciones GO/KEGG o su estructura intrón-exón? ¿Querés saber qué genes están próximos? ¿Tenés los ID de tus genes y querés recuperar los de transcritos/proteínas o incluso convertirlos entre distintas bases de datos? ¿Tenés una tabla de variantes (por ejemplo, SNPs) y querés predecir su posible efecto? ¿Buscás los dominios de un set de proteínas? En este seminario-taller hands-on, vamos a explorar distintas herramientas de Ensembl para realizar estas tareas (y otras más) de manera user friendly